Semua manuskrip yang diserahkan kepada Jurnal Al-Mutharahah: Jurnal Penelitian dan Kajian Sosial Keagamaan menjalani proses penyaringan dan peninjauan yang ketat untuk memastikan bahwa naskah tersebut sesuai dengan ruang lingkup jurnal dan memiliki kualitas akademik dan hal baru yang cukup untuk menarik minat pembaca. Jurnal Al-Mutharahah: Jurnal Penelitian dan Kajian Sosial Keagamaan menggunakan ulasan sejawat, di mana identitas penulis dan peninjau disembunyikan satu sama lain. Adapun tahapannya berikut ini:

1. Pengecekan awal naskah yang masuk.
2. Tinjauan oleh rekan sejawat.
3. Keputusan pertama.
4. Tahap revisi oleh penulis.
5. Keputusan terakhir.